Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms