Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms