Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms