Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam50bQ9WTJ8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms