Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms