Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim3Q9R1R2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms