Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms