Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed2Q9R0Q3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms