Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L9

Cd164, Sialomucin core protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164Q9R0L9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd164Q9R0L9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms