Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms