Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek3Q9R0A5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms