Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gpc6Q9R087 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc6Q9R087 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gpc6Q9R087 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc6Q9R087 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gpc6Q9R087 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc6Q9R087 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc6Q9R087 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc6Q9R087 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc6Q9R087 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gpc6Q9R087 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gpc6Q9R087 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc6Q9R087 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc6Q9R087 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc6Q9R087 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc6Q9R087 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gpc6Q9R087 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc6Q9R087 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gpc6Q9R087 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gpc6Q9R087 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gpc6Q9R087 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gpc6Q9R087 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gpc6Q9R087 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gpc6Q9R087 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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