Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nubp2Q9R061 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nubp2Q9R061 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nubp2Q9R061 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nubp2Q9R061 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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