Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nubp1Q9R060 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp1Q9R060 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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