Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d3cQ9QZS8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms