Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms