Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmlQ9QZD5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms