Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms