Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndrg3Q9QYF9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms