Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms