Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp1Q9QY53 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp1Q9QY53 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms