Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg2Q9QXK3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms