Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms