Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms