Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms