Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms