Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calm4Q9JM83 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calm4Q9JM83 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms