Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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