Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms