Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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