Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Irx5Q9JKQ4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Irx5Q9JKQ4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx5Q9JKQ4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Irx5Q9JKQ4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Irx5Q9JKQ4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Irx5Q9JKQ4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Irx5Q9JKQ4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Irx5Q9JKQ4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Irx5Q9JKQ4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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