Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms