Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpa33Q9JKA5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms