Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms