Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms