Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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