Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Bco1Q9JJS6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Bco1Q9JJS6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Bco1Q9JJS6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Bco1Q9JJS6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Bco1Q9JJS6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Bco1Q9JJS6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Bco1Q9JJS6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bco1Q9JJS6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bco1Q9JJS6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 515.8 ms