Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms