Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms