Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus3Q9JI38 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms