Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Cxcl11Q9JHH5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Cxcl11Q9JHH5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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Cxcl11Q9JHH5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Cxcl11Q9JHH5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Cxcl11Q9JHH5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Cxcl11Q9JHH5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Cxcl11Q9JHH5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcl11Q9JHH5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Cxcl11Q9JHH5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Cxcl11Q9JHH5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Cxcl11Q9JHH5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Cxcl11Q9JHH5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl11Q9JHH5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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