Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tcirg1Q9JHF5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms