Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Cldn19Q9ET38 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Cldn19Q9ET38 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Cldn19Q9ET38 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Cldn19Q9ET38 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Cldn19Q9ET38 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Cldn19Q9ET38 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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