Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tm9sf3Q9ET30 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms