Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim39Q9ESN2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms