Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms