Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms