Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp29Q9ES63 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp29Q9ES63 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp29Q9ES63 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Usp29Q9ES63 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Usp29Q9ES63 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Usp29Q9ES63 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Usp29Q9ES63 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Usp29Q9ES63 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Usp29Q9ES63 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp29Q9ES63 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Usp29Q9ES63 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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