Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms