Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERZ3

Chrm3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm3Q9ERZ3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm3Q9ERZ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm3Q9ERZ3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm3Q9ERZ3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm3Q9ERZ3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm3Q9ERZ3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm3Q9ERZ3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm3Q9ERZ3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm3Q9ERZ3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm3Q9ERZ3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms